Донуса заселена уже тысячи лет. Находки раннекикладской эпохи (III тысячелетие до н.э.) свидетельствуют о присутствии человека уже на заре Кикладской цивилизации, когда небольшие острова Эгейского моря служили остановками на морских путях между Наксосом, Аморгосом и остальными Кикладами.
Важнейший археологический памятник острова — укреплённое геометрическое поселение в Вафи Лименари (IX–VIII вв. до н.э.), рядом с Мерсини — хорошо сохранившееся свидетельство жизни в ранние исторические времена. Согласно местному преданию, название острова связано с Дионисом, который, как гласит миф, спрятал здесь Ариадну, чтобы защитить её от Тесея.
В средневековые и новые времена Донуса разделяла судьбу Малых Киклад: малонаселённая и подверженная пиратским набегам, она часто служила убежищем для пастухов и рыбаков соседних Аморгоса и Наксоса. Постоянные жители обосновались прочно в основном в более поздние века, живя рыболовством, животноводством и небольшими посевами.
Десятилетиями остров оставался отрезанным от мира, с трудным сообщением и минимальной инфраструктурой — это и уберегло нетронутым его подлинный характер. Сегодня, с несколькими десятками постоянных жителей и тёплой общиной, Донуса живёт рыболовством и мягким, альтернативным туризмом, который ищет именно то, что предлагает остров: тишину, природу и искреннее гостеприимство.