Миконос вместе с Делосом, Ринией и несколькими безымянными скалистыми островками образуют единую островную систему. Миконос представляет собой остров площадью 75 кв. км. с плоским рельефом со средней высотой 364 м. Остров в основном состоит из гранита и почти лишен деревьев - лишь некоторые его части (Панормос, Калафатис, Фтелия) покрыты зеленым кустарником.
Островок Риния (всего 13 кв. км) используется для выпаса животных. Частично он покрыт колючим кустарником, но есть на Ринии и заброшенные поля. На крошечном Трагониси (1,1 кв.км), скалистом и обрывистом, обнаружены месторождения металлических руд. Еще на одном микроострове архипелага – Стаподии (0,5 кв.км) скалистые обрывы чередуются с зарослями кустарников и небольшими равнинами.
Климат Миконоса характеризуется как умеренный, достаточно сухой, как правило, с мягкими зимами. Климатической особенностью острова являются сильные северные ветры (известные как «мельтеми»), дующие летом в течения дня. Снег – редчайшее явление на Миконосе, дождей летом не бывает вовсе, да и зимой они идут нечасто. Солнце в летний период всегда яркое и обжигающее, о чем стоит помнить туристам.
«Лунный пейзаж» Миконоса скрывает гораздо более интенсивную островную жизнь, нежели может показаться на первый взгляд: среди голых холмов от глаз пришельца прячется множество маленьких сокровищ. Большая шипастая ящерица, обитающая в камнях, имеет значительно больше прав на звание символа Миконоса, нежели его знаменитый пеликан. От этой миконосской ящерицы, часто встречающейся в землях Ионии, унаследовал свое имя нильский крокодил. Когда ионийцы прибыли в Египет, они узнали в облике крокодилов, которые до того времени назывались египтянами «хампсай», черты тех самых ящериц со своей родины, и дали крокодилам то же имя. На Миконосе эта ящерица и сегодня называется «крокодилаки» или «коркодилос», и ее присутствие на острове весьма заметно (по материалам статьи Ахиллеса Димитропулоса, Музей естественной истории Гуландри).
Прибрежные водно-болотные угодья в Панормосе и Фтелии в период сезонных затоплений превращаются в небольшие лагуны, которые используют для временных остановок перелетные птицы.
Потоки и водоемы образуются во многих частях острова, например, в районе Марафи, где возникла естественная плотина и водный бассейн, а также в районе Ано Мера. Песчаные берега острова богаты кварцевым песком.
Животноводство находится здесь на грани угасания, но все же на острове продолжают производить такие уникальные местные продукты, как «копанисти» (вид мягкого пикантного сыра), «ксинотира» (твердый пикантный сыр), деликатесные мясные изделия, «лузес», «паидес», которые высоко ценятся местными и иностранными гурманами.
Нельзя не упомянуть знаменитые миконосские миндальные сладости «амигдалота» восточного типа, обладающие превосходным вкусом и ароматом, и безалкогольный прохладительный напиток «сумада», изготовляемый также на основе миндаля.
Миконосская «луза» - характерная местная закуска, которая соревнуется в популярности у знатоков греческой кухни с миконосскими колбасками. Этот традиционный деликатес производят из местной свинины: на приготовление «лузы» идет цельное филе с хребта с небольшим жирком. Мясо, обильно посыпанное солью, перцем и пряностями, завяливается под действием солнца и северного ветра первых дней зимы. Готовая луза может долго храниться в морозильной камере (чтобы избежать высыхания). При подаче нарезается тончайшими ломтиками, которые имеют глубокий темно-красный цвет и оставляют во рту неповторимый богатый вкус и аромат.
Малая луза, приготовляемая из свиной вырезки и еще более нежная, называется «бубуло».
Миконосский пикантный сыр «копанисти» - это чудесная закуска к узо или любому другому крепкому греческому аперитиву. Копанисти подают на хлебе или, по миконосской традиции, на размоченном ячменном сухарике, с томатом или огурцом.
Копанисти получают в результате регулируемого повторяющегося сквашивания под контролем опытного сыродела на основе местного сыра из смешанного козьего и овечьего молока. Зрелый копанисти хорошо хранить в глиняной или стеклянной посуде. Этот вид сыра производят и на других кикладских островах, но миконосский копанисти считается самым ароматным.