古风时期曾被称作Pagali、Psychia、Karkissia和Melania，阿摩尔戈斯岛上曾有这三座城市：阿克希尼、米诺亚和艾吉亚里。据古代地理学家和辞典编纂家著作所述，这些城市已被鉴定为今日的卡斯特丽、卡塔波拉的牧达利亚，及托拉丽亚的维格拉。考古研究也指明阿摩尔戈斯岛在公元前五千年开始有人类居住，在古风时期与纳索斯岛、帕罗斯岛和其它小岛皆有联系。
岛上的基克拉泽斯文明证据，诸如充满象征性的大理石人像等，出现于公元前三千年。之后该岛受米利都和纳索斯殖民统治，因此岛上也有米诺斯文明影响的迹象。阿摩尔戈斯岛也是第一雅典同盟或雅典邦联的成员。在公元前三至二世纪，岛上落入马其顿人手中，其后又落入托勒密人、萨摩斯人、罗德岛和罗马人手中，而原先盛行的希腊式崇拜仪式在公元四世纪被全面终止，古老的神庙被基督教圣地一一取代。后来岛上遭到撒拉逊海盗劫掠，迫使居民往内陆撤退，并死守在各定居点如卡斯特罗、卡斯特丽以及其它23座防御塔内，其遗迹至今在岛上仍随处可见。
圣母Hozoviotissa的圣画被认为拥有奇迹力量，该画在偶像敌视时期由巴勒斯坦移往岛上，该时期偶像崇拜受到抵制。修道院在1088年进行大规模修缮，并由拜占庭皇帝亚历克西斯康姆尼纽斯亲自监督进行。
紧接着岛屿进入威尼斯人统治时期。这个时代的建筑遗迹包括Gavras高塔(o pyrgos tou Gavra)、Kato Lakkos和石头砌成的Lozes。
这一时期之后是土耳其统治时期，在此期间，阿摩尔戈斯岛上的经济达到了高峰，并经历了宗教复兴。 1822年，在希腊独立革命之后，本岛成为新兴现代希腊的教区所在地。七年后的1829年，在Panayia Hozoviotissa修道院的资助之下，希腊第一间学校在此诞生。
第二次世界大战期间，岛上人口大幅缩减，大量岛民迁移到都市地区甚至是国外。而在过去的二十年间，岛上的旅游业发展突飞猛进。