Chora est la capitale de Naxos, son centre administratif et le port de l'île. Beaucoup de monuments à Chora, comme Portara, le site archéologique de Grotta et le Château Vénitien, révèlent le passé de la ville. On peut y trouver le Musée Archéologique et la Collection Folklorique de Vasilis et de Cathrine Koutelieris. Pendant l'été, les gens se réunissent à la plage d'Ai-Giorgis (une grande grève à la côté sud de Chora), mais il y a beaucoup d'autres qui préfèrent la plage de Grotta, à la côté nord de Chora, près du port. Au marché de Chora vous trouverez tous les produits locaux, des pièces d'art populaire, des vêtements et des bijoux. Il y a aussi beaucoup de tavernes et de restaurants où vous pouvez jouir de la cuisine grecque et traditionnelle. En se qui concerne le divertissement nocturne, il y a des endroits pour chaque âge et chaque préférence. Chora est liée avec tous les villages et toutes les plages de Naxos par du transport régulier.
Chalki, au centre du basin de Tragea, est la capitale et le centre administratif de la seconde municipalité de Naxos, la Municipalité de Drymalia qui comprend les îles de Tragea et de Naxos montagneuse. La région de Tragea, au centre de Naxos, est couverte des oliviers et des arbres fruitiers et elle est la région la plus riche et a plus féconde de l'île. Autour de Chalki, parmi les arbres, il y a les villages de Tragea suivants: Kaloxylos, Akadimoi, Cheimarros, Tsikalario, Damarionas, Damalas. La région s'appelle "Mikros (petit) Mystras" grâce au grand nombre de ses églises (elles datent du 6ème jusqu'au 14ème siècle).
Damarionas: il s'agit d'un village qui a beaucoup de jolies maisons de maître et beaucoup d'elles sont rénovées aujourd'hui. Ses résidents s'occupent de la culture des oliviers, de l'agriculture et de l'élevage. Au centre du village, il y l'église ancienne de Christ avec une iconostase en bois et des icônes anciennes.
Damalas: il s'agit d'un petit village pittoresque avec quelques résidents permanents. Il vaut visiter la huilière traditionnelle rénovée et l'atelier de poteries à l'entrée du village.
Moni: le village se trouve à une pente et donne sur le bassin de Tragea. Il a pris son nom à cause du temple de Panagia Drosiani qui était un monastère (moni: monastère en grec). Il est aussi connu pour ses tissus à tisser.
Kinidaros: il s'agit d'un joli village qui est connu pour ses produits d'élevage et pour ses fêtes. Près de Kinidaros, il y a la fontaine par laquelle Chora est approvisionnée en eau. Il y a aussi des carrières de marbre à la région. Les soirs d'été, beaucoup de fiestas avec des musiciens de la région sont organisées aux tavernes du village.
Melanes: le village se trouve à une pente féconde. Il y a des eaux courantes qui remuaient les moulins à eau jadis. La pente de Melanes comprend les petits villages Kourounochori et Myloi. Le château de Frangopoulos nous rappelle que la région était un fief très important de Naxos pendant la période de l'occupation vénitienne. Près de Melanes, au site Flerio, au bord d'un verger il y a l'un des deux Kouroi archaïques de Naxos.
Potami: il s'agit de trois petits villages (Ano Potamia, Mesi Potamia, Kato Potamia) qui sont bâtis au long d'une vallée toute verte parmi des vergers fruitiers. Les moulins à eau vieux forment une caractéristique spéciale et la région est idéale pour des randonnées.
Sagkri: il est bâti à un plateau fécond avec des oliviers, 11 km sud-est de Chora. La région est très intéressante et elle a beaucoup d'attractions comme le monastère-château de la Sainte Croix (16ème siècle) qui a été rénové récemment et beaucoup d'événements y ont lieu, le monastère de Saint Eleftherios, l'église byzantine de Saint Nikolaos, l'église de Saint Artemios (8ème- 9ème siècle) qui a été bâtie pendant la période de l'iconoclaste, et le château de Somaripa, à Kato Sagkri. Au sud du village, au site Gyroulas, il y a le temple archaïque de Déméter. De plus, au 12ème kilomètre de la route centrale qui lie Chora et Sagkri, le château de Bazaios domine la plaine d'Agiassos.
Filoti: Un peu plus loin de Tragea, la route monte vers Za, la montagne la plus haute des Cyclades (1004m) et traverse le village Filoti qui est bâti en amphithéâtre au pied de Za. Il s'agit d'un grand village de Naxos avec une activité intense. Il y a des restaurants, des cafés, des bars et un marché. L'église du village, Panagia Filiotissa, est une des plus belles de Naxos avec des icônes rares, une iconostase de marbre et un clocher sculpté. Il vaut aussi visiter le château de Barotsis. Une route qui se termine au château de Cheimarros commence de Filoti.
Danakos: il s'agit d'un petit village, qui est bâti au fond d'une vallée, avec des eaux abondantes qui remuaient les moulins à eau pendant le passé. Près du village, à un endroit merveilleux il y a le Monastère de Fotodotis, le plus ancien de Naxos. L'église de Sainte Marina se trouve à la bifurcation de la route vers Danakos et un chemin vers le sommet de Za y commence.
Apeiranthos est bâti au centre de Naxos montagneuse, à pied de Mont Fanari. Elle s'appelle aussi "Marmarino Chorio" (le village en marbre).Son style architecturel est préservé de la période vénitienne, et il se distingue des autres villages par son dialecte et par ses mœurs et coutumes. La majorité de ses résidents est venue des villages montagneux de la Crète au 17ème siècle. Il est connu pour le penchant de ses résidents pour la poésie et pour l'art en général. Les femmes sont très aptes à l'art de tisser. Le château de Zevgolis (17ème siècle) est très impressionnant et il est bâti sur une roche a à l'entrée du village. Vous pouvez goûter le vin fameux de Naxos montagneuse aux tavernes et aux cafés de la région. À la région il y aussi beaucoup de remarquables églises byzantines. Il vaut visiter les musées suivants:
- Le Musée Archéologique
- Le Musée Géologique d'Apeiranthos
- Le Musée Folklorique d'Apeiranthos, et
- Le Musée d'Histoire Naturelle d'Apeiranthos
Keramoti est bâti au fond d'un vallon. Sauf le vin, il est aussi connu pour son miel. À la rue centrale, à l'hauteur de Keramoti, il y a l'église de Stavros. De ce point-là, vous pouvez voir les côtes est et ouest de l'île.
Koronos est bâti dans une vallée au pied est du Mont Koronos à une altitude de 540 mètres. Il s'agit d'un joli village pittoresque avec le caractère îlien intense. Pendant les années passées, ses résidents travaillaient aux mines d'émeri de la région. Avec la trouvaille de l'émeri artificiel et la fermeture des mines les résidents se sont allés aux villes plus grandes. Aux cafés et aux tavernes de l'île vous pouvez goûter le vin unique et fameux de Naxos montagneuse. Il vaut aussi visiter le Musée Folklorique. Hors du village, il y a l'église de Panagia Argokoiliotissa où beaucoup de fideles se réunissent chaque an à sa fiesta.
Skado: il s'agit d'un joli village montagneux qui est bâti à une pente de vignes.
Galanado: il s'agit d'un joli village pittoresque qui est bâti sur la route centrale vers Tragea à une distance de 8 km de Chora. La plupart de ses résidents sont des agriculteurs et des éleveurs. Un peu plus loin du village, il y a le château vénitien de Belonias ainsi que l'église de Saint Ioannis.
Glinado: il s'agit d'un village plein de vie avec un marché, des tavernes et un élevage développé. À l'entrée du village, il y a l'église d'Agios Nikodimos, le protecteur de Naxos. Dans le champ, entre Glinado et la mer, au site Yria, le temple archaïque de Dionysos a été trouvé.
Agios Arsenios est un village avec de jolies maisons et des parvis en ordre. Il vaut visiter l'église de Saint Spyridon. Autour du village et au sein du champ, il y a beaucoup de chapelles ainsi que le monastère de Saint Prodrome.
Tripodes: il s'agit d'un joli village avec des chemins pavés et des moulins désertés. À l'entrée du village, il y a l'église de Panagia avec son iconostase en bois et ses icônes rares. Sur la route de terre qui lie le village et la plage de Plaka, il y a les ruines de Palaiopyrgos de Plaka.
Engares: il s'agit d'un joli village tout vert à l'est de la vallée d'Engares (8 km nord-est de Chora). Il vaut visiter l'Huilière d 'Engares, le Château de Prantounas et le Monastère de Faneromeni. Il y a deux barrages artificiels à la région, c'est à dire le barrage d'Engares et le barrage de Faneromeni qui est en construction.
Galini: il s'agit d'un petit village avec de jolies maisons qui est bâti dans la vallée d'Engares (7 km nord-est de Chora). Entre le village et la plage d'Amitis, il y a le château-monastère d'Ypsilotera qui était le refuge ainsi que le repaire des agriculteurs pendant la période de l'occupation des Francs.