L'histoire d'Ios, en général, est la même que l'histoire des autres îles des Cyclades.
On doit faire une mention spéciale au poète épique Homère qui était le poète le plus important de l'histoire et qui a composé l'Iliade et l'Odyssée. Sa mère, Klimeni, est née et morte à Ios. Son tombeau se trouve à la région "Plakotos". Selon la légende, Homère est aussi mort à Ios ne pouvant pas résoudre l'énigme posée par les pêcheurs de la région de Plakotos.
Au début, Ios à été influencée par les gens des côtes de l'Asie Mineure, qui y ont fait des colonies. Les réussites de la Civilisation Minoenne (2000-1500 avant Jésus-Christ) ont été enterrées sous la lave du volcan de Santorini. Autour de 1100 avant Jésus-Christ les Doriens et les Ioniens arrivent à l'île et lui donnent son nom. Ensuite Ios est devenue membre de la Confédération Athénienne et au début de 13ème siècle avant Jésus-Christ elle est prise par les Vénitiens et il y avait une période très importante autour de 1397 après Jésus-Christ quand le gouverneur de l'île, Markos Krispos, a fortifié Chora avec les murs du Château les ruines desquels existent jusqu'aujourd'hui.
Enfin, en 1537, Ios se soumet aux Turcs et une période de taxation lourde et de beaucoup de malheurs commence- en même temps elle souffre à cause des attaques des pirates. Les conquérants Turcs appelaient l'île "Petite Malte" à cause de la sécurité absolue de son port naturel.
Pendant l'occupation des Turcs, Spyridon Valetas (1718-1843) d'Ios, qui était membre de l'Association des Amis, a été le premier Ministère de l'Éducation en Grèce moderne ainsi qu'un bienfaiteur de l'île.