Amorgos è l'isola del profondo azzuro. Si trova all'estremo sud est delle Cycladi, tra Naxos, le piccole Cycladi e Astypalaia. Amorgos è il passaggio naturale, il ponte di communicazione delle Cycladi con Dodecanese. Dista dal porto di Pireo 136 miglia nautiche.
Amorgos ha due porti naturali, Katapola al centro e Aigiali al nord. Gran parte delle sue coste è rocciosa. L' isola è lunga 18 miglia e larga da 1,5 a 5 miglia. Haunaformaallungataeunperimetrodi 112 chilometri.
Il paesaggio montagnoso si presenta selvaggio e scosceso sul posto di Aigiali situata sulla cima più alta (Kroukellos 821m.). Sul centro dell'isola ci sono (Profitis Ilias 698m.), sull'ovest (Aspro Vouno, Vouno tou Choriou o Koracas 630m.). In mezzo di queste masse montagnose ci sono alcune pianure, le principali di esse sono Kolafanas sul ovest, Katapoles sul centro e Aigiali sul nord. AltrepianuresonoKamario, ArkesinieAgiosPavlos.
La storia geologica dell'isola si differenzia dal resto delle Cycladi. La roccia più antica è schisto è quella più moderna la pietra calcare. Tutte è due si trovano sotto gran parte dell'isola. La forma definitiva che oggi ha Amorgos risulta dopo grandi affondamenti di alcune parti terrestri circa 700000 milla anni fa.
La vegetazione è tipica delle Cycladi, rada e cespugliosa con schini, prini, asparti, fuscelli. Sulle pianure fertili si trovano oliveti ed altri alberi da frutto. Vite, ortaggi di qualità alta e cereali (quantità limitata) vengono coltivati sui versanti terrazzati delle montagne. La vegetazione di Amorgos è molto ricca di erbe medicinali rare e piante endemiche.
Il clima è salubre ed assomiglia con quello del resto delle Isole Cycladi. Aigiali e calda d' estate per causa della morfologia del terreno che non permette ai “meltemi”(venti rinfrescanti di provenienza nord) ad entrare sull'interno dell'isola.