Μερικά από τα αξιοθέατα της Σχοινούσας είναι:
Η εκκλησία των Εισοδίων της Θεοτόκου με την Θαυματουργή Εικόνα της Παναγίας της Ακαθής στη Χώρα.
Η εκκλησία του Ευαγγελισμού στον παραδοσιακό οικισμό Μεσσαριά.
Η σπηλιά του Πειρατή στο δρόμο για το Λιμάνι.